Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTAP09496 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTAP09496 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTAP09496 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTAP09496 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTAP09496 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTAP09496 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTAP09496 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTAP09496 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTAP09496 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTAP09496 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLTAP09496 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLTAP09496 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLTAP09496 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CLTAP09496 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLTAP09496 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTAP09496 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTAP09496 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTAP09496 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTAP09496 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTAP09496 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTAP09496 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLTAP09496 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLTAP09496 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLTAP09496 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLTAP09496 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTAP09496 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTAP09496 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLTAP09496 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTAP09496 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTAP09496 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLTAP09496 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTAP09496 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTAP09496 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTAP09496 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTAP09496 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTAP09496 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTAP09496 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTAP09496 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTAP09496 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTAP09496 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTAP09496 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLTAP09496 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTAP09496 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTAP09496 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTAP09496 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTAP09496 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTAP09496 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTAP09496 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTAP09496 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLTAP09496 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTAP09496 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTAP09496 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTAP09496 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTAP09496 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTAP09496 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CLTAP09496 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTAP09496 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTAP09496 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTAP09496 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTAP09496 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTAP09496 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTAP09496 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CLTAP09496 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLTAP09496 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLTAP09496 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLTAP09496 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLTAP09496 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLTAP09496 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLTAP09496 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLTAP09496 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLTAP09496 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTAP09496 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTAP09496 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTAP09496 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTAP09496 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTAP09496 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTAP09496 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLTAP09496 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTAP09496 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTAP09496 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTAP09496 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTAP09496 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTAP09496 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTAP09496 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTAP09496 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTAP09496 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTAP09496 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTAP09496 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTAP09496 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTAP09496 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTAP09496 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTAP09496 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTAP09496 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTAP09496 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTAP09496 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTAP09496 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTAP09496 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTAP09496 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTAP09496 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms