Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD63P08962 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD63P08962 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD63P08962 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD63P08962 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD63P08962 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD63P08962 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD63P08962 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD63P08962 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD63P08962 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD63P08962 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD63P08962 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD63P08962 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD63P08962 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD63P08962 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD63P08962 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD63P08962 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD63P08962 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD63P08962 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD63P08962 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD63P08962 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD63P08962 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD63P08962 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD63P08962 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD63P08962 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD63P08962 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD63P08962 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD63P08962 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD63P08962 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD63P08962 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD63P08962 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD63P08962 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD63P08962 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD63P08962 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD63P08962 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD63P08962 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD63P08962 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD63P08962 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD63P08962 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD63P08962 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD63P08962 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD63P08962 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD63P08962 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD63P08962 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD63P08962 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD63P08962 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD63P08962 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD63P08962 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD63P08962 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD63P08962 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD63P08962 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD63P08962 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD63P08962 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CD63P08962 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD63P08962 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD63P08962 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD63P08962 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD63P08962 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD63P08962 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CD63P08962 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CD63P08962 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD63P08962 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD63P08962 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD63P08962 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD63P08962 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD63P08962 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD63P08962 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD63P08962 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD63P08962 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD63P08962 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD63P08962 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD63P08962 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD63P08962 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD63P08962 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD63P08962 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD63P08962 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD63P08962 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD63P08962 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD63P08962 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD63P08962 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD63P08962 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD63P08962 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD63P08962 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD63P08962 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD63P08962 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD63P08962 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD63P08962 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD63P08962 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD63P08962 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD63P08962 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD63P08962 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD63P08962 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD63P08962 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD63P08962 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD63P08962 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD63P08962 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD63P08962 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD63P08962 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD63P08962 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD63P08962 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms