Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMBSP08397 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMBSP08397 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMBSP08397 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMBSP08397 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HMBSP08397 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMBSP08397 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMBSP08397 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMBSP08397 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMBSP08397 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMBSP08397 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMBSP08397 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMBSP08397 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMBSP08397 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMBSP08397 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMBSP08397 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMBSP08397 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMBSP08397 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HMBSP08397 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HMBSP08397 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMBSP08397 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMBSP08397 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMBSP08397 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMBSP08397 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMBSP08397 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMBSP08397 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMBSP08397 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMBSP08397 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMBSP08397 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMBSP08397 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMBSP08397 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMBSP08397 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMBSP08397 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMBSP08397 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMBSP08397 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMBSP08397 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMBSP08397 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HMBSP08397 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMBSP08397 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMBSP08397 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMBSP08397 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMBSP08397 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HMBSP08397 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMBSP08397 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMBSP08397 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMBSP08397 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMBSP08397 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMBSP08397 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMBSP08397 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMBSP08397 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMBSP08397 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HMBSP08397 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMBSP08397 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMBSP08397 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HMBSP08397 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMBSP08397 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMBSP08397 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMBSP08397 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMBSP08397 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMBSP08397 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMBSP08397 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMBSP08397 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HMBSP08397 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HMBSP08397 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMBSP08397 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMBSP08397 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMBSP08397 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMBSP08397 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMBSP08397 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMBSP08397 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMBSP08397 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HMBSP08397 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMBSP08397 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMBSP08397 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMBSP08397 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMBSP08397 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMBSP08397 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMBSP08397 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMBSP08397 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMBSP08397 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMBSP08397 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMBSP08397 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMBSP08397 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMBSP08397 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMBSP08397 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMBSP08397 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HMBSP08397 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMBSP08397 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMBSP08397 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMBSP08397 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMBSP08397 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMBSP08397 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMBSP08397 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMBSP08397 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMBSP08397 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMBSP08397 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMBSP08397 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMBSP08397 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMBSP08397 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMBSP08397 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms