Protein–RNA interactions for Protein: P06730

EIF4E, Eukaryotic translation initiation factor 4E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EP06730 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EIF4EP06730 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EIF4EP06730 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EIF4EP06730 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms