Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPIND1P05546 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SERPIND1P05546 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPIND1P05546 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms