Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB2P05107 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB2P05107 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms