Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT1P04264 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT1P04264 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT1P04264 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT1P04264 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT1P04264 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT1P04264 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT1P04264 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT1P04264 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT1P04264 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT1P04264 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT1P04264 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT1P04264 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT1P04264 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT1P04264 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT1P04264 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT1P04264 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT1P04264 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT1P04264 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT1P04264 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT1P04264 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT1P04264 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT1P04264 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT1P04264 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT1P04264 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT1P04264 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT1P04264 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT1P04264 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT1P04264 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT1P04264 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT1P04264 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT1P04264 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT1P04264 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT1P04264 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT1P04264 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT1P04264 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT1P04264 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT1P04264 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT1P04264 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT1P04264 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT1P04264 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT1P04264 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT1P04264 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT1P04264 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT1P04264 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT1P04264 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT1P04264 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT1P04264 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT1P04264 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT1P04264 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT1P04264 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT1P04264 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT1P04264 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT1P04264 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT1P04264 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT1P04264 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT1P04264 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT1P04264 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT1P04264 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT1P04264 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT1P04264 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT1P04264 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT1P04264 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT1P04264 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT1P04264 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT1P04264 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT1P04264 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT1P04264 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT1P04264 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT1P04264 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT1P04264 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT1P04264 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT1P04264 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT1P04264 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT1P04264 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT1P04264 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT1P04264 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT1P04264 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT1P04264 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT1P04264 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT1P04264 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT1P04264 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT1P04264 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT1P04264 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT1P04264 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT1P04264 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT1P04264 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT1P04264 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT1P04264 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT1P04264 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT1P04264 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT1P04264 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT1P04264 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT1P04264 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT1P04264 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT1P04264 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT1P04264 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT1P04264 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT1P04264 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT1P04264 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms