Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN1SWP03999 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OPN1SWP03999 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms