Protein–RNA interactions for Protein: P03956

MMP1, Interstitial collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP1P03956 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MMP1P03956 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP1P03956 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP1P03956 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MMP1P03956 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP1P03956 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MMP1P03956 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP1P03956 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP1P03956 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP1P03956 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MMP1P03956 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP1P03956 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP1P03956 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP1P03956 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP1P03956 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP1P03956 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MMP1P03956 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MMP1P03956 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MMP1P03956 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP1P03956 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP1P03956 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP1P03956 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP1P03956 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP1P03956 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP1P03956 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP1P03956 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP1P03956 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP1P03956 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP1P03956 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP1P03956 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP1P03956 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP1P03956 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP1P03956 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP1P03956 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP1P03956 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP1P03956 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP1P03956 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP1P03956 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP1P03956 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP1P03956 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP1P03956 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP1P03956 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP1P03956 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP1P03956 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP1P03956 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP1P03956 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP1P03956 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP1P03956 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP1P03956 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP1P03956 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP1P03956 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP1P03956 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP1P03956 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP1P03956 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP1P03956 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP1P03956 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP1P03956 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP1P03956 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP1P03956 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MMP1P03956 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MMP1P03956 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMP1P03956 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP1P03956 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP1P03956 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP1P03956 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP1P03956 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP1P03956 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP1P03956 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP1P03956 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP1P03956 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP1P03956 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP1P03956 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP1P03956 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP1P03956 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP1P03956 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP1P03956 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP1P03956 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP1P03956 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP1P03956 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP1P03956 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP1P03956 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP1P03956 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP1P03956 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP1P03956 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP1P03956 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP1P03956 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP1P03956 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP1P03956 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP1P03956 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MMP1P03956 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MMP1P03956 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MMP1P03956 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP1P03956 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP1P03956 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP1P03956 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP1P03956 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP1P03956 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP1P03956 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP1P03956 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP1P03956 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms