Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA1P02647 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA1P02647 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA1P02647 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA1P02647 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA1P02647 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOA1P02647 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA1P02647 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA1P02647 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA1P02647 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA1P02647 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA1P02647 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA1P02647 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA1P02647 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA1P02647 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA1P02647 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA1P02647 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA1P02647 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA1P02647 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA1P02647 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA1P02647 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA1P02647 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA1P02647 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA1P02647 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA1P02647 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA1P02647 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA1P02647 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA1P02647 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA1P02647 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA1P02647 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA1P02647 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA1P02647 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA1P02647 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA1P02647 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA1P02647 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA1P02647 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA1P02647 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA1P02647 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA1P02647 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA1P02647 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA1P02647 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA1P02647 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOA1P02647 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA1P02647 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA1P02647 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA1P02647 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA1P02647 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA1P02647 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA1P02647 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA1P02647 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA1P02647 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA1P02647 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA1P02647 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA1P02647 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA1P02647 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA1P02647 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA1P02647 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA1P02647 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA1P02647 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA1P02647 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA1P02647 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA1P02647 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA1P02647 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA1P02647 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA1P02647 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA1P02647 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA1P02647 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA1P02647 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA1P02647 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA1P02647 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA1P02647 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA1P02647 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA1P02647 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA1P02647 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA1P02647 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA1P02647 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA1P02647 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA1P02647 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA1P02647 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA1P02647 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA1P02647 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA1P02647 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA1P02647 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA1P02647 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA1P02647 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA1P02647 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA1P02647 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA1P02647 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA1P02647 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA1P02647 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA1P02647 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA1P02647 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA1P02647 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA1P02647 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA1P02647 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA1P02647 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA1P02647 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOA1P02647 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOA1P02647 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOA1P02647 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms