Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAP29O95721 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP29O95721 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms