Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN7O95471 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN7O95471 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms