Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD4O95243 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD4O95243 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD4O95243 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD4O95243 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD4O95243 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD4O95243 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MBD4O95243 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MBD4O95243 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MBD4O95243 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MBD4O95243 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD4O95243 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD4O95243 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD4O95243 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD4O95243 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD4O95243 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD4O95243 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD4O95243 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD4O95243 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD4O95243 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD4O95243 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD4O95243 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD4O95243 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD4O95243 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD4O95243 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD4O95243 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD4O95243 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD4O95243 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD4O95243 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD4O95243 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD4O95243 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD4O95243 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD4O95243 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD4O95243 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD4O95243 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD4O95243 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MBD4O95243 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MBD4O95243 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MBD4O95243 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MBD4O95243 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MBD4O95243 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MBD4O95243 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MBD4O95243 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MBD4O95243 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MBD4O95243 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MBD4O95243 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD4O95243 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD4O95243 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD4O95243 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD4O95243 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD4O95243 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD4O95243 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD4O95243 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD4O95243 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD4O95243 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD4O95243 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD4O95243 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD4O95243 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD4O95243 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD4O95243 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD4O95243 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD4O95243 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD4O95243 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD4O95243 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD4O95243 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD4O95243 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD4O95243 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD4O95243 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD4O95243 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD4O95243 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD4O95243 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD4O95243 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD4O95243 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD4O95243 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD4O95243 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MBD4O95243 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MBD4O95243 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MBD4O95243 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MBD4O95243 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MBD4O95243 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MBD4O95243 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MBD4O95243 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MBD4O95243 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MBD4O95243 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MBD4O95243 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MBD4O95243 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MBD4O95243 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MBD4O95243 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MBD4O95243 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MBD4O95243 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MBD4O95243 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MBD4O95243 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MBD4O95243 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MBD4O95243 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MBD4O95243 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MBD4O95243 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MBD4O95243 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MBD4O95243 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MBD4O95243 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MBD4O95243 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms