Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
UBL3O95164 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBL3O95164 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBL3O95164 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBL3O95164 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBL3O95164 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBL3O95164 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBL3O95164 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBL3O95164 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBL3O95164 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBL3O95164 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBL3O95164 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBL3O95164 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBL3O95164 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBL3O95164 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBL3O95164 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBL3O95164 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBL3O95164 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBL3O95164 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBL3O95164 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBL3O95164 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBL3O95164 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBL3O95164 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBL3O95164 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBL3O95164 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBL3O95164 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBL3O95164 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBL3O95164 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBL3O95164 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL3O95164 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL3O95164 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL3O95164 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL3O95164 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL3O95164 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBL3O95164 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL3O95164 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL3O95164 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL3O95164 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL3O95164 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL3O95164 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL3O95164 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBL3O95164 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL3O95164 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL3O95164 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL3O95164 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL3O95164 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL3O95164 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL3O95164 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBL3O95164 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBL3O95164 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBL3O95164 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBL3O95164 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBL3O95164 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBL3O95164 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBL3O95164 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBL3O95164 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBL3O95164 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBL3O95164 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBL3O95164 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBL3O95164 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBL3O95164 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBL3O95164 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBL3O95164 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UBL3O95164 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBL3O95164 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBL3O95164 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBL3O95164 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBL3O95164 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBL3O95164 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBL3O95164 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBL3O95164 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBL3O95164 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBL3O95164 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBL3O95164 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBL3O95164 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBL3O95164 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBL3O95164 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBL3O95164 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBL3O95164 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UBL3O95164 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBL3O95164 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBL3O95164 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBL3O95164 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBL3O95164 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBL3O95164 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBL3O95164 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBL3O95164 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBL3O95164 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBL3O95164 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBL3O95164 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBL3O95164 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBL3O95164 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBL3O95164 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBL3O95164 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBL3O95164 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBL3O95164 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBL3O95164 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBL3O95164 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBL3O95164 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBL3O95164 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms