Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHOBTB3O94955 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHOBTB3O94955 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms