Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DKK1O94907 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DKK1O94907 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DKK1O94907 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DKK1O94907 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DKK1O94907 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DKK1O94907 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DKK1O94907 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DKK1O94907 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DKK1O94907 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DKK1O94907 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DKK1O94907 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DKK1O94907 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DKK1O94907 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DKK1O94907 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DKK1O94907 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DKK1O94907 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DKK1O94907 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DKK1O94907 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DKK1O94907 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DKK1O94907 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DKK1O94907 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DKK1O94907 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DKK1O94907 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DKK1O94907 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DKK1O94907 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DKK1O94907 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DKK1O94907 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DKK1O94907 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DKK1O94907 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DKK1O94907 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DKK1O94907 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DKK1O94907 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DKK1O94907 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DKK1O94907 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DKK1O94907 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DKK1O94907 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DKK1O94907 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DKK1O94907 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DKK1O94907 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DKK1O94907 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DKK1O94907 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DKK1O94907 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DKK1O94907 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DKK1O94907 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DKK1O94907 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DKK1O94907 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DKK1O94907 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DKK1O94907 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DKK1O94907 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DKK1O94907 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DKK1O94907 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DKK1O94907 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DKK1O94907 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DKK1O94907 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DKK1O94907 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DKK1O94907 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DKK1O94907 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DKK1O94907 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DKK1O94907 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DKK1O94907 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DKK1O94907 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DKK1O94907 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DKK1O94907 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DKK1O94907 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DKK1O94907 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DKK1O94907 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DKK1O94907 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DKK1O94907 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DKK1O94907 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DKK1O94907 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DKK1O94907 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DKK1O94907 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DKK1O94907 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DKK1O94907 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DKK1O94907 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DKK1O94907 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DKK1O94907 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DKK1O94907 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DKK1O94907 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DKK1O94907 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DKK1O94907 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DKK1O94907 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DKK1O94907 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DKK1O94907 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DKK1O94907 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DKK1O94907 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DKK1O94907 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DKK1O94907 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DKK1O94907 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DKK1O94907 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DKK1O94907 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DKK1O94907 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DKK1O94907 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DKK1O94907 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DKK1O94907 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DKK1O94907 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DKK1O94907 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DKK1O94907 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DKK1O94907 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms