Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
UFL1O94874 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UFL1O94874 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UFL1O94874 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
UFL1O94874 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
UFL1O94874 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
UFL1O94874 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UFL1O94874 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UFL1O94874 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
UFL1O94874 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
UFL1O94874 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UFL1O94874 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UFL1O94874 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UFL1O94874 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UFL1O94874 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UFL1O94874 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UFL1O94874 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UFL1O94874 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UFL1O94874 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UFL1O94874 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UFL1O94874 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
UFL1O94874 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
UFL1O94874 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UFL1O94874 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UFL1O94874 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UFL1O94874 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UFL1O94874 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UFL1O94874 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UFL1O94874 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UFL1O94874 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UFL1O94874 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UFL1O94874 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UFL1O94874 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
UFL1O94874 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UFL1O94874 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UFL1O94874 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
UFL1O94874 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UFL1O94874 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UFL1O94874 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UFL1O94874 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UFL1O94874 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UFL1O94874 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UFL1O94874 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UFL1O94874 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UFL1O94874 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UFL1O94874 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UFL1O94874 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UFL1O94874 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UFL1O94874 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UFL1O94874 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UFL1O94874 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UFL1O94874 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UFL1O94874 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UFL1O94874 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UFL1O94874 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UFL1O94874 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UFL1O94874 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UFL1O94874 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UFL1O94874 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UFL1O94874 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UFL1O94874 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
UFL1O94874 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UFL1O94874 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
UFL1O94874 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UFL1O94874 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
UFL1O94874 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
UFL1O94874 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UFL1O94874 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UFL1O94874 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UFL1O94874 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UFL1O94874 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UFL1O94874 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UFL1O94874 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UFL1O94874 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UFL1O94874 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UFL1O94874 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UFL1O94874 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UFL1O94874 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UFL1O94874 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UFL1O94874 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UFL1O94874 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
UFL1O94874 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UFL1O94874 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UFL1O94874 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UFL1O94874 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UFL1O94874 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UFL1O94874 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UFL1O94874 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UFL1O94874 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UFL1O94874 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UFL1O94874 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UFL1O94874 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UFL1O94874 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UFL1O94874 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UFL1O94874 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
UFL1O94874 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UFL1O94874 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UFL1O94874 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UFL1O94874 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
UFL1O94874 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms