Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBBP9O75884 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP9O75884 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms