Protein–RNA interactions for Protein: O75558

STX11, Syntaxin-11, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX11O75558 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX11O75558 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX11O75558 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX11O75558 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX11O75558 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX11O75558 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX11O75558 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX11O75558 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX11O75558 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX11O75558 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX11O75558 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX11O75558 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX11O75558 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX11O75558 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX11O75558 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX11O75558 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX11O75558 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX11O75558 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX11O75558 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX11O75558 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX11O75558 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX11O75558 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX11O75558 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX11O75558 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX11O75558 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX11O75558 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
STX11O75558 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX11O75558 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX11O75558 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX11O75558 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX11O75558 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX11O75558 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX11O75558 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX11O75558 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX11O75558 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX11O75558 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
STX11O75558 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX11O75558 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX11O75558 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX11O75558 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX11O75558 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX11O75558 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX11O75558 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX11O75558 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX11O75558 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX11O75558 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX11O75558 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX11O75558 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STX11O75558 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX11O75558 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX11O75558 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX11O75558 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX11O75558 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX11O75558 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX11O75558 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX11O75558 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX11O75558 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX11O75558 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX11O75558 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX11O75558 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX11O75558 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX11O75558 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX11O75558 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STX11O75558 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX11O75558 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX11O75558 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX11O75558 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX11O75558 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX11O75558 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX11O75558 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX11O75558 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STX11O75558 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX11O75558 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX11O75558 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX11O75558 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX11O75558 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX11O75558 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX11O75558 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX11O75558 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX11O75558 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX11O75558 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX11O75558 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX11O75558 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX11O75558 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX11O75558 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STX11O75558 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STX11O75558 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX11O75558 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX11O75558 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX11O75558 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX11O75558 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX11O75558 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX11O75558 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX11O75558 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX11O75558 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX11O75558 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX11O75558 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX11O75558 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX11O75558 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX11O75558 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms