Protein–RNA interactions for Protein: O75509

TNFRSF21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF21O75509 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNFRSF21O75509 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFRSF21O75509 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms