Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN11O75508 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLDN11O75508 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms