Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMIM24O75264 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM24O75264 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM24O75264 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms