Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT3O75175 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT3O75175 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms