Protein–RNA interactions for Protein: O60779

SLC19A2, Thiamine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A2O60779 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC19A2O60779 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC19A2O60779 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC19A2O60779 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC19A2O60779 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC19A2O60779 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC19A2O60779 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC19A2O60779 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A2O60779 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A2O60779 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A2O60779 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A2O60779 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A2O60779 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC19A2O60779 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC19A2O60779 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC19A2O60779 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC19A2O60779 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC19A2O60779 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC19A2O60779 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC19A2O60779 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms