Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX2O60749 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX2O60749 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX2O60749 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX2O60749 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX2O60749 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX2O60749 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX2O60749 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX2O60749 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX2O60749 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX2O60749 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX2O60749 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX2O60749 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX2O60749 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX2O60749 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX2O60749 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX2O60749 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX2O60749 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX2O60749 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX2O60749 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX2O60749 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX2O60749 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX2O60749 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX2O60749 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX2O60749 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX2O60749 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX2O60749 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX2O60749 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX2O60749 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX2O60749 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX2O60749 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX2O60749 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX2O60749 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX2O60749 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX2O60749 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX2O60749 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX2O60749 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX2O60749 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX2O60749 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX2O60749 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX2O60749 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX2O60749 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX2O60749 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX2O60749 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX2O60749 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX2O60749 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX2O60749 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX2O60749 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX2O60749 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX2O60749 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX2O60749 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX2O60749 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX2O60749 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX2O60749 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX2O60749 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX2O60749 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX2O60749 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX2O60749 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX2O60749 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX2O60749 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX2O60749 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX2O60749 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX2O60749 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX2O60749 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX2O60749 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX2O60749 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX2O60749 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX2O60749 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX2O60749 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX2O60749 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX2O60749 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX2O60749 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX2O60749 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX2O60749 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX2O60749 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX2O60749 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX2O60749 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX2O60749 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX2O60749 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX2O60749 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX2O60749 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX2O60749 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX2O60749 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX2O60749 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX2O60749 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX2O60749 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX2O60749 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX2O60749 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX2O60749 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX2O60749 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX2O60749 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX2O60749 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX2O60749 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX2O60749 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX2O60749 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX2O60749 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX2O60749 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX2O60749 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX2O60749 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX2O60749 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms