Protein–RNA interactions for Protein: O60671

RAD1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD1O60671 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD1O60671 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD1O60671 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD1O60671 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD1O60671 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD1O60671 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD1O60671 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD1O60671 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD1O60671 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD1O60671 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD1O60671 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD1O60671 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD1O60671 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD1O60671 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD1O60671 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD1O60671 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD1O60671 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD1O60671 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD1O60671 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD1O60671 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD1O60671 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD1O60671 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD1O60671 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD1O60671 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD1O60671 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD1O60671 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD1O60671 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD1O60671 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD1O60671 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD1O60671 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD1O60671 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD1O60671 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD1O60671 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD1O60671 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD1O60671 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD1O60671 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD1O60671 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD1O60671 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD1O60671 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD1O60671 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD1O60671 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD1O60671 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD1O60671 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD1O60671 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD1O60671 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD1O60671 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD1O60671 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD1O60671 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD1O60671 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD1O60671 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD1O60671 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD1O60671 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD1O60671 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD1O60671 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD1O60671 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD1O60671 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD1O60671 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD1O60671 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD1O60671 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD1O60671 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD1O60671 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD1O60671 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD1O60671 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD1O60671 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD1O60671 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD1O60671 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD1O60671 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD1O60671 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD1O60671 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD1O60671 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD1O60671 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD1O60671 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD1O60671 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD1O60671 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD1O60671 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD1O60671 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD1O60671 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD1O60671 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD1O60671 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD1O60671 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD1O60671 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD1O60671 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD1O60671 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD1O60671 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD1O60671 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD1O60671 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD1O60671 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD1O60671 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD1O60671 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD1O60671 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD1O60671 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD1O60671 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD1O60671 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD1O60671 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD1O60671 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD1O60671 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD1O60671 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD1O60671 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD1O60671 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD1O60671 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms