Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG3O60359 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG3O60359 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms