Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VEGFDO43915 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms