Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT7O43581 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT7O43581 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT7O43581 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT7O43581 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT7O43581 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT7O43581 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT7O43581 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT7O43581 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT7O43581 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT7O43581 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT7O43581 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT7O43581 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT7O43581 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT7O43581 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT7O43581 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYT7O43581 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT7O43581 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT7O43581 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT7O43581 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT7O43581 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT7O43581 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT7O43581 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT7O43581 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT7O43581 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT7O43581 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT7O43581 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT7O43581 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT7O43581 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT7O43581 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT7O43581 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT7O43581 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT7O43581 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT7O43581 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT7O43581 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT7O43581 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT7O43581 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT7O43581 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT7O43581 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT7O43581 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT7O43581 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT7O43581 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT7O43581 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT7O43581 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYT7O43581 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYT7O43581 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYT7O43581 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYT7O43581 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYT7O43581 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYT7O43581 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT7O43581 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT7O43581 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT7O43581 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT7O43581 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT7O43581 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT7O43581 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT7O43581 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT7O43581 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT7O43581 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT7O43581 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT7O43581 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT7O43581 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT7O43581 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT7O43581 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SYT7O43581 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SYT7O43581 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYT7O43581 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SYT7O43581 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SYT7O43581 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SYT7O43581 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYT7O43581 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYT7O43581 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYT7O43581 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYT7O43581 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYT7O43581 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SYT7O43581 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYT7O43581 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYT7O43581 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYT7O43581 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYT7O43581 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYT7O43581 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT7O43581 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT7O43581 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT7O43581 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT7O43581 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT7O43581 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT7O43581 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT7O43581 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT7O43581 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT7O43581 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT7O43581 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT7O43581 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT7O43581 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT7O43581 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT7O43581 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYT7O43581 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYT7O43581 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYT7O43581 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYT7O43581 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYT7O43581 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms