Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KCNQ3O43525 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
KCNQ3O43525 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KCNQ3O43525 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KCNQ3O43525 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KCNQ3O43525 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
KCNQ3O43525 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KCNQ3O43525 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KCNQ3O43525 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KCNQ3O43525 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
KCNQ3O43525 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
KCNQ3O43525 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KCNQ3O43525 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KCNQ3O43525 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KCNQ3O43525 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
KCNQ3O43525 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KCNQ3O43525 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KCNQ3O43525 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KCNQ3O43525 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KCNQ3O43525 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KCNQ3O43525 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KCNQ3O43525 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KCNQ3O43525 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KCNQ3O43525 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KCNQ3O43525 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KCNQ3O43525 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KCNQ3O43525 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KCNQ3O43525 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms