Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTSS1O43312 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTSS1O43312 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms