Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC7A4O43246 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC7A4O43246 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC7A4O43246 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms