Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBDO15205 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBDO15205 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBDO15205 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBDO15205 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBDO15205 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBDO15205 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBDO15205 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBDO15205 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBDO15205 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBDO15205 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBDO15205 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBDO15205 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBDO15205 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBDO15205 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBDO15205 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBDO15205 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBDO15205 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBDO15205 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBDO15205 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBDO15205 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBDO15205 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBDO15205 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBDO15205 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBDO15205 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBDO15205 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBDO15205 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBDO15205 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBDO15205 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBDO15205 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBDO15205 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBDO15205 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBDO15205 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBDO15205 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UBDO15205 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBDO15205 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBDO15205 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
UBDO15205 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBDO15205 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBDO15205 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBDO15205 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBDO15205 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBDO15205 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBDO15205 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBDO15205 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBDO15205 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBDO15205 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBDO15205 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBDO15205 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBDO15205 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBDO15205 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBDO15205 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBDO15205 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBDO15205 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBDO15205 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBDO15205 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBDO15205 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBDO15205 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBDO15205 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBDO15205 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBDO15205 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBDO15205 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBDO15205 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBDO15205 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBDO15205 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBDO15205 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBDO15205 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBDO15205 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBDO15205 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBDO15205 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBDO15205 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBDO15205 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBDO15205 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBDO15205 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBDO15205 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBDO15205 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBDO15205 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBDO15205 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBDO15205 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBDO15205 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBDO15205 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBDO15205 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBDO15205 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBDO15205 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBDO15205 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBDO15205 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBDO15205 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBDO15205 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBDO15205 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBDO15205 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBDO15205 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBDO15205 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBDO15205 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBDO15205 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBDO15205 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBDO15205 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBDO15205 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBDO15205 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBDO15205 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBDO15205 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms