Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARPC1BO15143 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms