Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASKO14936 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASKO14936 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASKO14936 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASKO14936 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASKO14936 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASKO14936 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASKO14936 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASKO14936 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASKO14936 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASKO14936 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASKO14936 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASKO14936 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASKO14936 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASKO14936 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASKO14936 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASKO14936 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASKO14936 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASKO14936 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASKO14936 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASKO14936 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASKO14936 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASKO14936 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASKO14936 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASKO14936 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASKO14936 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASKO14936 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASKO14936 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASKO14936 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASKO14936 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASKO14936 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASKO14936 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASKO14936 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASKO14936 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASKO14936 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASKO14936 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASKO14936 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASKO14936 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASKO14936 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASKO14936 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASKO14936 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASKO14936 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASKO14936 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASKO14936 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASKO14936 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASKO14936 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASKO14936 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASKO14936 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASKO14936 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASKO14936 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASKO14936 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASKO14936 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CASKO14936 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASKO14936 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASKO14936 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASKO14936 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASKO14936 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASKO14936 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASKO14936 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASKO14936 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASKO14936 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASKO14936 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASKO14936 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASKO14936 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASKO14936 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASKO14936 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CASKO14936 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASKO14936 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CASKO14936 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASKO14936 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASKO14936 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASKO14936 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASKO14936 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASKO14936 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASKO14936 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASKO14936 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CASKO14936 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASKO14936 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASKO14936 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASKO14936 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASKO14936 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASKO14936 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASKO14936 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASKO14936 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASKO14936 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASKO14936 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASKO14936 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASKO14936 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASKO14936 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASKO14936 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASKO14936 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASKO14936 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASKO14936 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASKO14936 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASKO14936 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CASKO14936 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASKO14936 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASKO14936 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASKO14936 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASKO14936 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms