Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRF6O14896 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRF6O14896 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRF6O14896 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRF6O14896 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRF6O14896 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRF6O14896 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRF6O14896 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF6O14896 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF6O14896 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF6O14896 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF6O14896 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF6O14896 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF6O14896 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF6O14896 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF6O14896 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF6O14896 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRF6O14896 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRF6O14896 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRF6O14896 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRF6O14896 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRF6O14896 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRF6O14896 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRF6O14896 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
IRF6O14896 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRF6O14896 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRF6O14896 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRF6O14896 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRF6O14896 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRF6O14896 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRF6O14896 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRF6O14896 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRF6O14896 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRF6O14896 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRF6O14896 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRF6O14896 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRF6O14896 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRF6O14896 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRF6O14896 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRF6O14896 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRF6O14896 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IRF6O14896 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRF6O14896 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRF6O14896 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
IRF6O14896 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IRF6O14896 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IRF6O14896 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IRF6O14896 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IRF6O14896 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IRF6O14896 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IRF6O14896 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IRF6O14896 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
IRF6O14896 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRF6O14896 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRF6O14896 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRF6O14896 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRF6O14896 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRF6O14896 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRF6O14896 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRF6O14896 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRF6O14896 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRF6O14896 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRF6O14896 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
IRF6O14896 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
IRF6O14896 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRF6O14896 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
IRF6O14896 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRF6O14896 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRF6O14896 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
IRF6O14896 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRF6O14896 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRF6O14896 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRF6O14896 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRF6O14896 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRF6O14896 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRF6O14896 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRF6O14896 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRF6O14896 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRF6O14896 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRF6O14896 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRF6O14896 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRF6O14896 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRF6O14896 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRF6O14896 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRF6O14896 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRF6O14896 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRF6O14896 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRF6O14896 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRF6O14896 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRF6O14896 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRF6O14896 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRF6O14896 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRF6O14896 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF6O14896 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF6O14896 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF6O14896 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF6O14896 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF6O14896 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF6O14896 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF6O14896 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms