Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPEO14579 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPEO14579 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPEO14579 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPEO14579 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COPEO14579 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPEO14579 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPEO14579 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPEO14579 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPEO14579 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPEO14579 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPEO14579 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPEO14579 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPEO14579 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPEO14579 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COPEO14579 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPEO14579 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPEO14579 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPEO14579 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
COPEO14579 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
COPEO14579 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
COPEO14579 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPEO14579 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPEO14579 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPEO14579 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPEO14579 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPEO14579 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPEO14579 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPEO14579 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPEO14579 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPEO14579 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPEO14579 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COPEO14579 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPEO14579 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPEO14579 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPEO14579 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPEO14579 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPEO14579 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPEO14579 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPEO14579 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPEO14579 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPEO14579 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPEO14579 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPEO14579 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPEO14579 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPEO14579 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPEO14579 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPEO14579 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPEO14579 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPEO14579 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPEO14579 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPEO14579 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPEO14579 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPEO14579 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPEO14579 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPEO14579 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPEO14579 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPEO14579 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPEO14579 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPEO14579 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPEO14579 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPEO14579 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPEO14579 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COPEO14579 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COPEO14579 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPEO14579 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPEO14579 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPEO14579 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPEO14579 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPEO14579 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPEO14579 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPEO14579 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPEO14579 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPEO14579 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPEO14579 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPEO14579 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPEO14579 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPEO14579 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPEO14579 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPEO14579 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPEO14579 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPEO14579 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPEO14579 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPEO14579 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPEO14579 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPEO14579 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPEO14579 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COPEO14579 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPEO14579 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPEO14579 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPEO14579 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPEO14579 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPEO14579 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPEO14579 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPEO14579 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPEO14579 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPEO14579 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPEO14579 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPEO14579 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPEO14579 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms