Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOCS6O14544 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOCS6O14544 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms