Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
CUX2O14529 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
CUX2O14529 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CUX2O14529 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CUX2O14529 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CUX2O14529 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CUX2O14529 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CUX2O14529 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CUX2O14529 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CUX2O14529 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CUX2O14529 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CUX2O14529 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
CUX2O14529 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
CUX2O14529 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
CUX2O14529 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
CUX2O14529 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CUX2O14529 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CUX2O14529 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CUX2O14529 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CUX2O14529 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
CUX2O14529 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
CUX2O14529 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CUX2O14529 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CUX2O14529 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CUX2O14529 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
CUX2O14529 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
CUX2O14529 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CUX2O14529 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CUX2O14529 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
CUX2O14529 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
CUX2O14529 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CUX2O14529 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
CUX2O14529 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CUX2O14529 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CUX2O14529 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
CUX2O14529 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
CUX2O14529 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CUX2O14529 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CUX2O14529 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CUX2O14529 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CUX2O14529 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CUX2O14529 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CUX2O14529 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
CUX2O14529 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
CUX2O14529 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CUX2O14529 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CUX2O14529 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CUX2O14529 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CUX2O14529 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CUX2O14529 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CUX2O14529 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CUX2O14529 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CUX2O14529 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CUX2O14529 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CUX2O14529 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CUX2O14529 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CUX2O14529 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CUX2O14529 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CUX2O14529 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CUX2O14529 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CUX2O14529 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CUX2O14529 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.27
CUX2O14529 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CUX2O14529 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CUX2O14529 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CUX2O14529 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
CUX2O14529 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CUX2O14529 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CUX2O14529 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CUX2O14529 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CUX2O14529 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CUX2O14529 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CUX2O14529 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CUX2O14529 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
CUX2O14529 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
CUX2O14529 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CUX2O14529 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CUX2O14529 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
CUX2O14529 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
CUX2O14529 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CUX2O14529 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CUX2O14529 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CUX2O14529 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CUX2O14529 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CUX2O14529 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CUX2O14529 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CUX2O14529 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CUX2O14529 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CUX2O14529 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CUX2O14529 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CUX2O14529 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CUX2O14529 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CUX2O14529 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
CUX2O14529 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
CUX2O14529 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CUX2O14529 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CUX2O14529 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CUX2O14529 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CUX2O14529 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CUX2O14529 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
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