Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP56O00567 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP56O00567 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP56O00567 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP56O00567 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP56O00567 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP56O00567 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP56O00567 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP56O00567 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP56O00567 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP56O00567 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP56O00567 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP56O00567 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP56O00567 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP56O00567 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP56O00567 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP56O00567 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP56O00567 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP56O00567 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP56O00567 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP56O00567 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP56O00567 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP56O00567 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP56O00567 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP56O00567 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP56O00567 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOP56O00567 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NOP56O00567 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOP56O00567 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOP56O00567 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NOP56O00567 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOP56O00567 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP56O00567 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP56O00567 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP56O00567 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP56O00567 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP56O00567 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP56O00567 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP56O00567 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP56O00567 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP56O00567 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP56O00567 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP56O00567 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP56O00567 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP56O00567 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP56O00567 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP56O00567 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP56O00567 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP56O00567 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP56O00567 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP56O00567 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP56O00567 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP56O00567 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP56O00567 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP56O00567 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP56O00567 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP56O00567 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP56O00567 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP56O00567 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP56O00567 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NOP56O00567 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP56O00567 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP56O00567 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP56O00567 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP56O00567 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP56O00567 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP56O00567 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP56O00567 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP56O00567 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOP56O00567 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NOP56O00567 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NOP56O00567 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP56O00567 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP56O00567 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP56O00567 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP56O00567 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP56O00567 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP56O00567 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP56O00567 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP56O00567 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP56O00567 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP56O00567 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP56O00567 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP56O00567 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP56O00567 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP56O00567 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP56O00567 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP56O00567 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP56O00567 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP56O00567 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOP56O00567 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOP56O00567 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOP56O00567 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOP56O00567 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOP56O00567 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOP56O00567 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOP56O00567 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NOP56O00567 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOP56O00567 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOP56O00567 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms