Protein–RNA interactions for Protein: O00541

PES1, Pescadillo homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PES1O00541 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PES1O00541 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PES1O00541 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PES1O00541 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PES1O00541 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PES1O00541 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PES1O00541 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PES1O00541 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PES1O00541 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PES1O00541 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PES1O00541 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PES1O00541 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PES1O00541 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PES1O00541 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PES1O00541 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PES1O00541 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PES1O00541 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PES1O00541 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PES1O00541 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PES1O00541 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PES1O00541 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PES1O00541 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PES1O00541 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PES1O00541 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PES1O00541 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PES1O00541 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PES1O00541 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PES1O00541 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PES1O00541 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PES1O00541 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PES1O00541 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PES1O00541 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PES1O00541 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PES1O00541 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PES1O00541 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PES1O00541 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PES1O00541 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PES1O00541 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PES1O00541 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PES1O00541 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PES1O00541 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PES1O00541 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PES1O00541 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PES1O00541 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PES1O00541 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PES1O00541 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PES1O00541 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PES1O00541 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PES1O00541 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PES1O00541 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PES1O00541 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PES1O00541 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PES1O00541 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PES1O00541 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PES1O00541 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PES1O00541 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PES1O00541 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PES1O00541 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PES1O00541 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PES1O00541 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PES1O00541 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PES1O00541 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PES1O00541 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PES1O00541 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PES1O00541 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PES1O00541 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PES1O00541 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PES1O00541 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PES1O00541 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PES1O00541 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PES1O00541 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PES1O00541 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PES1O00541 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PES1O00541 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PES1O00541 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PES1O00541 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PES1O00541 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PES1O00541 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PES1O00541 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PES1O00541 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PES1O00541 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PES1O00541 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PES1O00541 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PES1O00541 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PES1O00541 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PES1O00541 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PES1O00541 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PES1O00541 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PES1O00541 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PES1O00541 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PES1O00541 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PES1O00541 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PES1O00541 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PES1O00541 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PES1O00541 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PES1O00541 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PES1O00541 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PES1O00541 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PES1O00541 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PES1O00541 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms