Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KPNA3O00505 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KPNA3O00505 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms