Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B1O00203 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms