Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QW42 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QW42 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QW42 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QW42 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QW42 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QW42 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QW42 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QW42 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QW42 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QW42 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QW42 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QW42 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QW42 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QW42 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QW42 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QW42 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QW42 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QW42 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QW42 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QW42 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QW42 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QW42 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QW42 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QW42 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QW42 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QW42 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QW42 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QW42 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
J3QW42 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QW42 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QW42 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QW42 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QW42 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QW42 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QW42 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QW42 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QW42 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QW42 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QW42 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QW42 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QW42 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QW42 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QW42 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QW42 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QW42 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QW42 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QW42 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QW42 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QW42 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QW42 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QW42 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QW42 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QW42 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QW42 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QW42 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QW42 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QW42 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QW42 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QW42 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QW42 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QW42 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QW42 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QW42 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QW42 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QW42 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QW42 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QW42 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QW42 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QW42 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QW42 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QW42 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QW42 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QW42 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QW42 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QW42 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QW42 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QW42 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QW42 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QW42 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QW42 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QW42 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QW42 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QW42 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QW42 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QW42 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QW42 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QW42 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QW42 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QW42 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QW42 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QW42 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QW42 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QW42 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QW42 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QW42 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QW42 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QW42 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QW42 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QW42 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms