Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
I3L4J1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
I3L4J1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
I3L4J1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
I3L4J1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
I3L4J1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
I3L4J1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
I3L4J1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
I3L4J1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
I3L4J1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
I3L4J1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
I3L4J1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
I3L4J1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
I3L4J1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
I3L4J1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
I3L4J1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
I3L4J1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
I3L4J1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
I3L4J1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
I3L4J1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
I3L4J1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
I3L4J1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
I3L4J1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
I3L4J1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
I3L4J1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
I3L4J1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
I3L4J1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
I3L4J1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
I3L4J1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
I3L4J1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
I3L4J1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
I3L4J1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
I3L4J1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
I3L4J1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
I3L4J1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
I3L4J1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
I3L4J1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
I3L4J1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
I3L4J1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
I3L4J1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
I3L4J1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
I3L4J1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
I3L4J1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
I3L4J1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
I3L4J1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
I3L4J1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
I3L4J1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
I3L4J1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
I3L4J1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
I3L4J1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
I3L4J1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
I3L4J1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
I3L4J1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
I3L4J1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
I3L4J1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
I3L4J1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
I3L4J1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
I3L4J1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
I3L4J1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
I3L4J1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
I3L4J1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
I3L4J1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
I3L4J1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
I3L4J1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
I3L4J1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
I3L4J1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
I3L4J1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
I3L4J1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
I3L4J1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
I3L4J1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
I3L4J1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
I3L4J1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
I3L4J1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
I3L4J1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
I3L4J1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
I3L4J1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
I3L4J1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
I3L4J1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
I3L4J1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
I3L4J1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
I3L4J1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
I3L4J1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
I3L4J1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
I3L4J1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
I3L4J1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
I3L4J1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
I3L4J1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
I3L4J1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
I3L4J1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
I3L4J1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
I3L4J1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
I3L4J1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
I3L4J1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
I3L4J1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
I3L4J1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
I3L4J1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
I3L4J1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
I3L4J1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
I3L4J1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
I3L4J1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms