Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BNC9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BNC9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BNC9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BNC9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BNC9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BNC9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BNC9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BNC9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BNC9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BNC9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BNC9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BNC9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BNC9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BNC9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BNC9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BNC9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BNC9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BNC9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H3BNC9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H3BNC9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H3BNC9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H3BNC9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H3BNC9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BNC9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BNC9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BNC9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BNC9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BNC9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BNC9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BNC9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BNC9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BNC9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BNC9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BNC9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H3BNC9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H3BNC9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H3BNC9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H3BNC9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H3BNC9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
H3BNC9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
H3BNC9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H3BNC9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H3BNC9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H3BNC9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H3BNC9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BNC9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BNC9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BNC9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BNC9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BNC9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BNC9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BNC9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BNC9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H3BNC9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
H3BNC9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H3BNC9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BNC9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BNC9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BNC9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BNC9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BNC9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BNC9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BNC9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BNC9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BNC9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BNC9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BNC9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BNC9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BNC9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BNC9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BNC9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BNC9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BNC9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BNC9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BNC9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BNC9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BNC9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BNC9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BNC9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BNC9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BNC9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BNC9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BNC9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BNC9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BNC9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BNC9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BNC9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BNC9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BNC9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BNC9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BNC9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H3BNC9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H3BNC9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
H3BNC9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
H3BNC9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
H3BNC9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BNC9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BNC9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BNC9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms