Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L11C9JVI0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L11C9JVI0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L11C9JVI0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L11C9JVI0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L11C9JVI0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L11C9JVI0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L11C9JVI0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L11C9JVI0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L11C9JVI0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L11C9JVI0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L11C9JVI0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L11C9JVI0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L11C9JVI0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L11C9JVI0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L11C9JVI0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L11C9JVI0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms