Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
B4E1Z4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
B4E1Z4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
B4E1Z4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
B4E1Z4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
B4E1Z4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
B4E1Z4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
B4E1Z4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
B4E1Z4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
B4E1Z4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
B4E1Z4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
B4E1Z4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
B4E1Z4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
B4E1Z4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
B4E1Z4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
B4E1Z4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
B4E1Z4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
B4E1Z4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
B4E1Z4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
B4E1Z4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
B4E1Z4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
B4E1Z4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
B4E1Z4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
B4E1Z4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
B4E1Z4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
B4E1Z4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
B4E1Z4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
B4E1Z4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
B4E1Z4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
B4E1Z4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
B4E1Z4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
B4E1Z4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
B4E1Z4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
B4E1Z4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
B4E1Z4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
B4E1Z4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
B4E1Z4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
B4E1Z4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
B4E1Z4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
B4E1Z4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
B4E1Z4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
B4E1Z4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
B4E1Z4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
B4E1Z4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
B4E1Z4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
B4E1Z4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
B4E1Z4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
B4E1Z4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
B4E1Z4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
B4E1Z4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
B4E1Z4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
B4E1Z4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
B4E1Z4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
B4E1Z4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
B4E1Z4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
B4E1Z4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
B4E1Z4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
B4E1Z4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
B4E1Z4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
B4E1Z4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4E1Z4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4E1Z4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4E1Z4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4E1Z4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4E1Z4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4E1Z4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
B4E1Z4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4E1Z4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4E1Z4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4E1Z4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4E1Z4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4E1Z4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4E1Z4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
B4E1Z4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
B4E1Z4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
B4E1Z4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
B4E1Z4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
B4E1Z4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
B4E1Z4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
B4E1Z4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4E1Z4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4E1Z4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4E1Z4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4E1Z4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4E1Z4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4E1Z4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4E1Z4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4E1Z4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4E1Z4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4E1Z4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4E1Z4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4E1Z4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
B4E1Z4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
B4E1Z4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
B4E1Z4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
B4E1Z4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
B4E1Z4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
B4E1Z4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
B4E1Z4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
B4E1Z4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms