Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DEV8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DEV8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DEV8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DEV8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DEV8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DEV8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DEV8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DEV8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B4DEV8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DEV8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DEV8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B4DEV8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DEV8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DEV8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DEV8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DEV8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DEV8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DEV8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DEV8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B4DEV8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DEV8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DEV8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DEV8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DEV8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DEV8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DEV8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DEV8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DEV8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DEV8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DEV8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DEV8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DEV8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DEV8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B4DEV8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DEV8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DEV8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DEV8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DEV8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DEV8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DEV8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DEV8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DEV8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DEV8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DEV8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DEV8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DEV8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DEV8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DEV8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DEV8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DEV8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DEV8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DEV8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DEV8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DEV8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DEV8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DEV8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DEV8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DEV8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DEV8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DEV8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DEV8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DEV8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DEV8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DEV8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DEV8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DEV8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DEV8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DEV8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DEV8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DEV8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DEV8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DEV8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DEV8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DEV8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4DEV8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4DEV8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
B4DEV8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4DEV8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DEV8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DEV8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DEV8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DEV8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DEV8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DEV8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DEV8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DEV8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DEV8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DEV8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DEV8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DEV8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DEV8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DEV8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DEV8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DEV8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DEV8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DEV8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DEV8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DEV8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DEV8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms