Protein–RNA interactions for Protein: B2RXF0

TMEM229A, Transmembrane protein 229A, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229AB2RXF0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM229AB2RXF0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM229AB2RXF0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM229AB2RXF0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM229AB2RXF0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM229AB2RXF0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms